ABSTRAK: UGPase merupakan enzim kunci yang memengaruhi terbentuknya polisakarida dengan ikatan β 1-4 glukosida. Interaksi enzim UGPase dengan subtrat (UDP-Glukosa) pada beberapa spesies tanaman umbi terdapat perbedaan. Berdasarkan hal itu, tujuan penelitian ini adalah untuk mengetahui interaksi UGPase dan UDP-G pada beberapa tanaman umbi. Hasil molecular docking menunjukkan interaksi catalytic domain dari enzim UGPase yang berikatan dengan UDP-G pada substrate binding loop, dengan total ΔG pada A. konjac paling rendah yaitu -5,06 kcal/mol diikuti oleh I. batatas dan S. tuberosum secara berturut-turut sebesar -4,60 dan -3,73 kcal/mol dan distabilkan dengan dua tipe interaksi yaitu interaksi elektrostatik dan hidrogen pada A. konjac dan I. Batatas, serta interaksi hidrofobik pada S. tuberosum.
Kata kunci: interaksi, UDP-Glukosa, UGPase
Penulis: Muhammad Badiul Ulum, Estri Laras Arumingtyas, Nia Kurniawan
Kode Jurnal: jpbiologidd130001
Share This :
comment 0 komentar
more_vert